宋莲生(张国立 饰)乃一江湖郎中，浪荡不羁医术高超，在长沙行医时巧遇绣庄庄主无双，被她深深吸引，于是在绣庄门前开起了门诊，并应允无双的请求帮助东林党购置大量伤药，违反了朝廷规定而面临死罪，由于九芝堂老板的妙计，宋莲生得以获救，后来又因此事与地痞齐大头(李耕 饰)结怨，抢救了闻世堂无能为力的病人，此堂名声大跌又遭仇视，更因为误会无双而离开长沙，地在途中发现当地闹瘟疫，疫算将蔓延至长沙，他即刻返回通知九芝堂大量购药，并控制药材销售，瘟疫得以控制，圣上欲赐堂号给立功的药房，闻世堂吴老太医的侄女如月(邓婕 饰)使出坏招，令九芝堂名声受损。逢九芝堂药材短缺，无双患重病，宋莲生无奈只得问闻世堂求助，如月又使用计谋令宋莲生被逐出长沙，无双亦带着支离破碎的心前往南京……宋莲生生性善良、好打抱不平，却在长沙被迫几度离返，可谓世事难料，人心叵测……
