机灵小不懂剧情介绍：一个偶然的机会，不懂帮孝宗渡过了一个难关。二人不知怎的，竟有点莫名的亲切感。孝宗派不懂到江南，寻找一名会种一种极品茶花的人，因为对方有可能是当年爱过的人。
江南梅龙镇一所极破落的小寺院“金阁寺”住着孝宗原来早已派来调查的无休和尚。无休患有轻微的老人痴呆症，记性不好，常把不懂弄得啼笑皆非，不懂只想快快把事情办妥，回迦叶寺过他以前的生活。
当地有贵族书院“观自在书院”，无休因感到茶花是出现在书院后山，所以怀疑种植的人是书院中的学生，于是派不懂前往书院担当老师，教授德业，从中调查。不懂被派负责的，是书院中最难缠的一班。班中的学生，都有各种不同的问题，其中为首的，正是院士的女儿籽言。不懂为了调查茶花一事，对各个学生都十分留意。不懂凭着各种稀奇古怪的教学方法，更将一个一个的学生教好。不懂开始满足了，他甚至喜欢上了当这个春风化雨的老师。
书院中有一名学生朱正，虽有才能，却极缺乏自信。不懂对他总有着一份莫明的亲切感，不但帮他恢复自信，更助他把心爱的女子李凤姐追到手里。却原来，这朱正便是当今太子，即孝宗之子。当此时，孝宗病重，不懂及无休虽查不出端倪，也被逼回去述职。
孝宗临危之际，忽然封了不懂为太傅兼大学士，宫拜一品，统率六部，匡扶新帝。不懂呆了，正要推辞之际，孝宗却已驾崩。
太子即位，改年号正德。原来这一切都是孝宗刻意的安排。当时朝内分党分派，各自为政，他希望不懂能以其稀奇的方法，令正德皇位便会稳固了。不懂没辜负孝宗的期望，慢慢开始见成效，百官终于归顺了。就在此时，不懂及正德却发现了一个天大的秘密；原来孝宗要不懂寻找的那个儿子不是别人，正是不懂自己。若论年纪，他比正德大，按法统，他才是真命天子。


大量插科打诨的笑料、周星驰式无厘头的幽默以及使用大量俗语和俚语的冗长对白，时而解颐的智力测验和脑筋急转弯，所有这些林林总总、光怪陆离的内容构成了全片的喜剧框架，这种休闲风格让观众感到惬意。