1989年，考入前线话剧团，现为南京军区前线话剧团演员。

1993年，出演首部电影《血岸情仇》饰演赵北天。

1994年，侯勇参演首部电视剧《乡亲》饰演赵广仁。

1996年，电视剧《野狐峪》饰演主人公亢二。

1999年，侯勇主演电视剧《壮志凌云》。

2001年，参演现代军事动作片《冲出亚马逊》饰特种兵中尉王晖，凭借这部电影获得2002年第8届中国电影华表奖优秀男演员奖，2003年第9届中国电影表演艺术学会金凤凰奖表演学会奖。

2002年，侯勇参演当代军人题材电视剧《DA师》。凭借电影《声震长空》获第6届中国长春电影节优秀男演员奖。

2003年，在电视剧《大染坊》饰演印染业奇才陈寿亭。获得2004年第22届中国电视金鹰奖暨第5届中国金鹰电视艺术节最佳表演艺术奖男演员奖、最受观众喜爱的电视剧男演员奖，第24届中国电视剧飞天奖优秀男演员奖三项大奖。

2003年，在电视剧《无愧苍生》饰演东北民主联军战士任福祥。电视剧《白银谷》饰演康三爷。出演电视剧《天高地厚》、《末代皇妃》。

2004年，主演电视剧《追日。在电视剧《中华之剑》饰演黑帮老大。在古装电视剧《开创盛世》饰演谏议大臣魏征。在《浪子燕青》饰演宋徽宗。出演电视剧《铁色高原》，在电视剧《陈赓大将》出演陈赓。

2005年，主演军事题材剧《沙场点兵》，出演电视剧《沧海英雄》，在都市情感剧《不能没有你》饰演沈阳，古装剧《风尘三侠之红拂女》中饰演唐高祖李渊。

2006年，在电视剧《大秦帝国》中饰演战国初期最杰出的君主秦孝公，主演影片《缉毒警》，出演电影《车祸疑云》。

2007年，在电视剧《井冈山》中扮演卢德铭，主演间谍剧《狂花凋落》，在电视剧《DA师》的续集《狼烟》中出演配角桂平原，电影《八月一日》饰演开国元勋贺龙，凭借影片获得第15届北京大学生电影节最受大学生喜爱的男演员奖以及第1届北京影视春燕奖电影最佳男配角奖。

2008年，在电影《赤壁》中饰演鲁肃，在军旅大戏《高地》饰演兰泽光。

2009年，侯勇出演电视剧《弹孔》饰演红军首长，主演悬疑剧《夜来香》，在电视剧《奠基者》饰演独臂将军余秋里，在电影《建国大业》中客串陈赓、主演电影《惊天动地》饰演某集团军摩步旅旅长唐新生。

2010年，主演家庭情感剧《幸福攻略》饰演居家男人，在《旗袍旗袍》中饰演上海滩“暗杀王”王九洲，在军事励志剧《我是特种兵》扮演特种兵大队长，在电影《建党伟业》饰唐绍仪。

2011年，主演大型海峡亲情剧《兄弟海》。在抗战剧《冬日惊雷》饰演副队长钱广来。在《我是特种兵之利刃出鞘》中出演狼牙特战旅大队长何志军。在黑色喜剧电影《一路惊心》中饰演公安局长。

2012年，参演电视剧《麻辣女兵》，主演电视剧《与狼共舞》饰演何掌柜，客串出演电影《血滴子》、《平壤之约》、《温故一九四二》。

2013年，主演温暖系大剧《温暖的日子》饰演铁匠三猛子。在《我是特种兵之火凤凰》饰演狼牙特战基地司令，出演影片《战将周希汉》扮演陈赓，在电影《80后的独立宣言》与何赛飞扮演夫妻。
2014年，在电视剧《吉鸿昌》中饰演民族英雄吉鸿昌。